NSUN3 (NOP2/Sun RNA Methyltransferase Family Member 3) is een gen dat codeert voor een RNA-methyltransferase dat betrokken is bij het modificeren van mitochondriale tRNA's. Deze modificatie is belangrijk voor een juiste mitochondriale eiwitsynthese en functie. Mutaties in NSUN3 zijn in verband gebracht met mitochondriale ziekten.